Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cntn6Q9JMB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cntn6Q9JMB8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cntn6Q9JMB8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntn6Q9JMB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms