Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rabgef1Q9JM13 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabgef1Q9JM13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabgef1Q9JM13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabgef1Q9JM13 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabgef1Q9JM13 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms