Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Higd1aQ9JLR9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Higd1aQ9JLR9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms