Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclk1Q9JLM8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclk1Q9JLM8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dclk1Q9JLM8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms