Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hip1rQ9JKY5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hip1rQ9JKY5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hip1rQ9JKY5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hip1rQ9JKY5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hip1rQ9JKY5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms