Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ldb3Q9JKS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ldb3Q9JKS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ldb3Q9JKS4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ldb3Q9JKS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms