Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AtrQ9JKK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtrQ9JKK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AtrQ9JKK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AtrQ9JKK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305.2 ms