Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rcan3Q9JKK0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rcan3Q9JKK0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rcan3Q9JKK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rcan3Q9JKK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rcan3Q9JKK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rcan3Q9JKK0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rcan3Q9JKK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rcan3Q9JKK0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms