Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra4Q9JJT2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gfra4Q9JJT2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gfra4Q9JJT2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gfra4Q9JJT2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms