Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms