Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rpf2Q9JJ80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rpf2Q9JJ80 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpf2Q9JJ80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms