Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc12a4Q9JIS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a4Q9JIS8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms