Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl28Q9JIL2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl28Q9JIL2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms