Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn12Q9ET43 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn12Q9ET43 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn12Q9ET43 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms