Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snap29Q9ERB0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Snap29Q9ERB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snap29Q9ERB0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms