Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tor1bQ9ER41 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1bQ9ER41 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tor1bQ9ER41 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tor1bQ9ER41 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tor1bQ9ER41 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms