Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms