Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ndufa8Q9DCJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndufa8Q9DCJ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms