Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cmtr1Q9DBC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cmtr1Q9DBC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cmtr1Q9DBC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms