Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf4Q9DAW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf4Q9DAW6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4Q9DAW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf4Q9DAW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf4Q9DAW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms