Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim23Q9DAL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smim23Q9DAL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim23Q9DAL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim23Q9DAL0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms