Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3bQ9DA80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph3bQ9DA80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms