Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf138rt1Q9D9M9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf138rt1Q9D9M9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rnf138rt1Q9D9M9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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