Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actrt2Q9D9L5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt2Q9D9L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Actrt2Q9D9L5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actrt2Q9D9L5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms