Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D8N1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D8N1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D8N1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D8N1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D8N1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D8N1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D8N1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D8N1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D8N1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D8N1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D8N1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D8N1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms