Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fip1l1Q9D824 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fip1l1Q9D824 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fip1l1Q9D824 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fip1l1Q9D824 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms