Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srp19Q9D7A6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp19Q9D7A6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp19Q9D7A6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms