Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc81Q9D5W4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc81Q9D5W4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc81Q9D5W4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms