Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9D5Q8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D5Q8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D5Q8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D5Q8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms