Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3a3Q9D554 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3a3Q9D554 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sf3a3Q9D554 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3a3Q9D554 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms