Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam227bQ9D518 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam227bQ9D518 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam227bQ9D518 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms