Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox2aQ9D4Y3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox2aQ9D4Y3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms