Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc105Q9D4K7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms