Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam90a1bQ9D4F3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam90a1bQ9D4F3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam90a1bQ9D4F3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms