Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrp2bpQ9D4C6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrp2bpQ9D4C6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp2bpQ9D4C6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms