Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Katnal2Q9D3R6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Katnal2Q9D3R6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Katnal2Q9D3R6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms