Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx20Q9D2Y5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx20Q9D2Y5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx20Q9D2Y5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx20Q9D2Y5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snx20Q9D2Y5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx20Q9D2Y5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx20Q9D2Y5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms