Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R8

Mrps33, 28S ribosomal protein S33, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps33Q9D2R8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrps33Q9D2R8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mrps33Q9D2R8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrps33Q9D2R8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrps33Q9D2R8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms