Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ube2cQ9D1C1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2cQ9D1C1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2cQ9D1C1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ube2cQ9D1C1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ube2cQ9D1C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ube2cQ9D1C1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2cQ9D1C1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ube2cQ9D1C1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms