Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem53Q9D0Z3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem53Q9D0Z3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms