Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gtf2e1Q9D0D5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gtf2e1Q9D0D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Gtf2e1Q9D0D5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms