Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
2610524H06RikQ9CZU9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
2610524H06RikQ9CZU9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610524H06RikQ9CZU9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610524H06RikQ9CZU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms