Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3eQ9CZT4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr3eQ9CZT4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr3eQ9CZT4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms