Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snf8Q9CZ28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snf8Q9CZ28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snf8Q9CZ28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snf8Q9CZ28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms