Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc8Q9CYA6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc8Q9CYA6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc8Q9CYA6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms