Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gins3Q9CY94 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins3Q9CY94 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gins3Q9CY94 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gins3Q9CY94 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms