Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Exo5Q9CXP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Exo5Q9CXP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Exo5Q9CXP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms