Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xrcc3Q9CXE6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Xrcc3Q9CXE6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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