Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yif1bQ9CX30 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Yif1bQ9CX30 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yif1bQ9CX30 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms