Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smyd3Q9CWR2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smyd3Q9CWR2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smyd3Q9CWR2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smyd3Q9CWR2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms